Nemo, un giovane e avventuroso pesce pagliaccio, viene inaspettatamente portato via dalla sua casa nella Grande Barriera Corallina e finito nell'acquario di uno studio dentistico. Toccherà al suo terribile padre Marlin e a Dory, un pesce amichevole ma smemorato, riportare Nemo a casa, incontrando lungo il cammino squali vegetariani, tartarughe surfiste, meduse ipnotiche, gabbiani affamati e molto altro.